Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms