Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNE4Q8N205 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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