Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf62Q7Z3J2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms