Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms