Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms