Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD54Q6NXT1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms