Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms