Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms