Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRPF38BQ5VTL8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRPF38BQ5VTL8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms