Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FRMPD1Q5SYB0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMPD1Q5SYB0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms