Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LDLRAP1Q5SW96 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LDLRAP1Q5SW96 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms