Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GREB1Q4ZG55 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms