Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LETM2Q2VYF4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LETM2Q2VYF4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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