Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FHOD3Q2V2M9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms