Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCB5Q2M3G0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms