Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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HIST2H2BEQ16778 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIST2H2BEQ16778 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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