Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FSCN1Q16658 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FSCN1Q16658 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms