Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms