Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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