Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA6Q15825 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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