Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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