Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB3GAP1Q15042 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB3GAP1Q15042 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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