Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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