Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CHD4Q14839 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHD4Q14839 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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