Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF2H3Q13889 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H3Q13889 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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