Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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