Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR5A1Q13285 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms