Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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