Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CALCOCO2Q13137 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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