Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHD3Q12873 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHD3Q12873 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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