Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BPTFQ12830 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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