Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms