Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNA1Q09470 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms