Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PUDPQ08623 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms