Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms