Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms