Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CENPEQ02224 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms