Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms