Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CDK16Q00536 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms