Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms