Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM3AP98173 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM3AP98173 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM3AP98173 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms