Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAP25P60880 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms