Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB25P57735 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB25P57735 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms