Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms