Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTPAP49638 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTPAP49638 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms