Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA4P48169 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms