Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms