Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD52P43351 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms