Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRATP43155 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms