Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX11P35716 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOX11P35716 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms